KhanBMS מאורגנת בחמישה דרגים רקורסיביים. כל דרג מפקד בדיוק על עשרה מהדרג הבא. התוצאה היא רשת השמדה המתרחבת ליניארית עם החומרה תוך שמירה על עומס קוגניטיבי קבוע למפעיל.
יחידת הלחימה הקטנה ביותר שאינה ניתנת לחלוקה. ב-KhanBMS זהו צוות אש של נכסים בלתי מאוישים: זוג CCA, אלמנט נחיל רחפנים, או צוות קרקע רובוטי. כל ארבן מריץ את ערימת ההחלטות המלאה על הסיפון ובעל סמכות על שרשרת ההשמדה שלו בתוך התורה.
עשרה ארבנים מסונכרנים לאפקט טקטי יחיד. שכבת הזוון מרכיבה מערכים באופן דינמי: חבילות SEAD, קווי מיסוך, שיירות לוגיסטיקה. טייסים ומפעילים מפקדים בדרג זה.
מסנכרן פעולות בלתי מאוישות בקנה מידה גדודי על פני מספר זוונים. מנהל הצלבה בין נכסי חיישן ויורה, מונע התנגשויות במרחב האווירי, ומקצה אפקטורים כנגד רשימת המטרות המשותפת.
פיקוד ברמה מבצעית על אוגדה אוטונומית. הטומן משלב אפקטים קינטיים, לוחמה אלקטרונית, סייבר ומידע לקצב מבצעי. נבנה כדי להילחם דרך תקשורת מוגבלת באמצעות כוונת תורתית שמורה במטמון.
הדרג היחיד שבו נוצרת כוונה. מפעילים בדרג החאן קובעים את כוונת המפקד, כללי התקשרות ופרמטרי משימה. כל מה שמתחת הוא אוטונומיה מוגבלת הפועלת בתוך מגבלות אלו. האדם נשאר בפיקוד — לא בלולאה.
